《表1 样品与参考基因组比对结果》

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《基于转录组分析铜绿假单胞菌DN1降解荧蒽特性》

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利用Illumina高通量测序平台HiSeq PE 150对荧蒽胁迫条件下菌株DN1迚行转彔组学测序，两个样本分别得到28 325 987条（CK、对照组、葡萄糖条件）和18 579 321条（EF、实验组、荧蒽条件）序列。将这些有效序列分别比对到核糖体和参考基因组DN1（CP017099）上过滤之后，分别得到28 098 931条和18 434 341条序列。能够比对到基因组多个位置的被称为Multiple matched Reads，这种Reads可信度较低，一般不用作基因表达差异分析；能够比对到基因组唯一位置的被称为Unique matched reads，可信度高。因此统计Unique matched reads用于后续分析，以保证分析结果的可信度。如表1所示，能够比对到基因组上的匹配序列分别占有效序列的99.19%（CK）和99.22%（EF），其中完全匹配的序列（mapping ratio）分别为82.34%和80.51%，而Multiple matched reads的比例较低，说明测序质量较好。