《表1 供试样品(Gala)与苹果(金冠)基因组序列的比对结果》

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《基于转录组分析鉴定苹果茉莉素响应基因》


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对照(CTRL1)和处理(MeJA)分别得到751 477 132 bp和751 612 960 bp的测序数据,其中分别有71.28%和72.06%定位于苹果基因组,44.23%和45.12%的序列与金冠苹果基因组(Velasco et al.,2010)中的基因完全匹配(表1)。Q20介于99.29%–99.32%之间,所有测序结果均达到质控要求(图1A),可用于后续分析。我们共筛选到937个差异表达基因,其中上调表达基因480个,下调表达基因457个(图1B)。