《表2 分离细菌16S rRNA和真菌ITS基因序列与数据库的比对结果》
将测序得到的细菌16S rRNA基因序列提交EzBioCloud数据库,真菌ITS基因序列提交GenBank数据库进行同源性比对。结果显示,分离得到的11株可能的致病微生物中,有10株为细菌,1株为真菌。10株细菌中,5株与芽胞杆菌属Bacillus模式菌株同源性最高,2株与肠杆菌属Enterobacter模式菌株同源性最高,另有3株分别与西地西菌属Cedecea、克雷伯氏菌属Klebsiella和沙雷氏菌属Serratia的模式菌株同源性最高。其中BHB18031和WQD18041的16S rRNA基因序列与数据库中最近似模式菌株的同源性分别为98.63%和98.37%,均低于98.65%,说明这2株细菌可能为新种。5株芽胞杆菌属细菌中,2株与高山芽胞杆菌41KF2bT的16S rRNA基因序列同源性最高,2株与沙福芽胞杆菌FO‐36bT的16S rRNA基因同源性最高,另1株则与枯草芽孢杆菌NCIB3610T最近似。本研究所分离的真菌WSH18112与撕裂腊孔菌Ceriporia lacerate FS16的ITS基因同源性最高(99.00%)。将全部序列提交GenBank,获得登录号(表2)。
图表编号 | XD0090413000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.22 |
作者 | 姚威威、鲍大鹏、陈洪雨、李金鑫、李燕、周陈力、李晓玲、吴莹莹 |
绘制单位 | 长春工业大学化学与生命科学学院、国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所、国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所、上海丰科生物科技股份有限公司、国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所、国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点 |
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