《表1 分离菌株16S rRNA基因序列在GenBank核酸数据库BLAST分析》

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《发病鲆鲽类分离菌株的16S rRNA基因测序分析》


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以引物对27F/1492R进行PCR扩增,获得1500 bp左右的DNA片段。对纯化的DNA片段进行测序,获得的16S rRNA基因序列提交至GenBank,登录号见表1。Blast结果显示,所得124个16S rRNA基因序列与GenBank核酸数据库序列的最高相似性达99%~100%,可鉴定到属的地位,其中,弧菌属(Vibrio sp.)数量最多,共分离到83株,占66.9%;其次依次为气单胞菌属(Aeromonas sp.)(共11株,占8.9%)、爱德华氏菌属(Edwardsiella sp.)(4株,占3.2%)、假交替单胞菌属(Pseudaltermonas sp.)(3株,占2.4%)和假单胞菌属(Pseudomonas sp.)(3株,占2.4%)等(表2)。在1999~2004年,分离到的细菌大部分属于弧菌属,占77.3%;在2005年以后,随着养殖技术的提高和养殖条件的改善,弧菌的比例逐渐下降,仅占29.6%,气单胞菌属和爱德华氏菌属的菌株逐渐增多,分别占40.7%和11.1%。