《表2 16S rRNA基因序列比对结果》

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《落地生根内生固氮菌多样性和促生特性》


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根据SDS-PAGE全细胞蛋白电泳聚类、IS-PCR指纹图谱聚类结果,每个类群选取一株代表菌株进行16S rRNA基因序列测定和分析,在GenBank和EzBioCloud数据库中比对序列,获得相似性最高菌株。EzBioCloud数据库中的比对结果如表2所示,16S rRNA基因系统发育树如图3所示。类群I与类芽孢杆菌(Paenibacillus stellifer DSM14472T)相似性为99.65%;类群II与巴西固氮螺菌(Azospirillum brasilense ATCC49958T)相似性为99.47%;类群III与类芽孢杆菌(Paenibacillus albidus Q4-3T)相似性最高,为97.44%;类群IV与拜氏固氮菌(Azotobacter beijerinckii ATCC19360T)相似性最高,为97.82%;类群V为克雷伯氏菌亚种(Klebsiella quasipneumoniae subsp.quasipneumoniae01A030T),相似性为99.78%。依据国际细菌分类委员会的定义,类群III和类群IV的16S rRNA基因序列与已知种的相似性在97%,可能为新种[18]。