《表2 测序数据与参考基因组的序列比对结果》

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《基于转录组测序的木薯性别决定相关基因挖掘》

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括号里数值为对应的比对率（%）

Raw data经过滤去杂后，共得到64189053条Clean reads，高质量碱基19.29 Gb，每个样品的高质量碱基均在6.30 Gb以上。3种花蕾的GC含量均在43.00%左右、Q30均在95.00%左右（表1），表明测序质量良好。将测序数据与参考基因组序列进行比对，结果如表2所示。木薯雄蕾、雌蕾和两性蕾对比到参考基因组上的Clean reads分别为42642272、42172402和43563432条，其中，参考基因组和单端的比对率均在77.00%左右、多位置比对率均小于0.80%，正、负链比对率均在39.00%左右，表明试验污染少、测序数据质量较好。从比对序列分布情况看，约有90.00%序列定位于外显子，仅有5.00%左右的序列定位于内含子和基因间区。序列比对到内含子和基因间区分别是由于m RNA前体、发生可变剪切的内含子保留或基因组注释不完善所致。