《表2 Clean Reads与参考基因组序列的比对结果》

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《玻璃化冻存对蒙古驴卵母细胞甲基化及GFM1、MRPL15基因表达水平的影响》

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注:（1）Clean Reads:过滤后序列的数目；（2）Mapped Reads:比对到基因组上多个位置的Reads数目；（3）Mapped Ratio:比对到基因组上多个位置的Reads数目占Clean Reads数目的比例；（4）Unique Mapped Reads:唯一比对到基因组上的Reads数目；（5）Unique Mapped Ratio:唯一比对到基

在比对分析过程中，采用Bismark（v0.16.3）进行Clean Reads与参考基因组序列的比对[3]。首先，测序Reads和参考基因组都分别进行了C-to-T和G-to-A（反向互补）的转换；将转换后的Reads同转换后的参考基因组序列进行两两比对（底层调用Bowtie2进行）；从4种平行比对结果中选取最好的一个作为最终比对结果，唯一比对Reads将用于后续甲基化信息的分析。Clean Reads与参考基因组序列的比对结果见表2。