《表3 Reads与参考序列比对情况》

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《秀珍菇不同生长阶段在低温刺激后的转录组及差异基因表达分析》

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将Trinity （v2.4.0）拼接得到的转录组作为参考序列，将每个样品的clean reads往参考序列上做比对，统计比对结果（表3）。3个菌丝体阶段文库和1个原基阶段文库的测序序列经过滤后得到高质量测序标签（Clean reads）总数S3（49 980 456）>S2（46642 306）>S1（45 722 382）>S0（41 544 496）。将所有高质量测序标签与参考序列进行比对，能定位到参考序列上的测序序列以S0占比最多，为83.22%；其次为S2占比83.10%和S1占比82.85%；S3最少，为82.59%（表3）。