《表3 Reads与参考基因组比对情况》

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《双孢蘑菇转录组测序及褐变相关基因的挖掘》

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注:total reads.为测序序列经过测序数据过滤后的数量统计（clean data）；total mapped.为能定位到基因组上测序序列的数量统计。multiple mapped.为在参考序列上有多个比对位置的测序序列的数量统计；uniquely mapped.为在参考序列上有唯一比对位置的测序序列的数量统计；reads m

由表3可知，Pile_C1、Pile_C7、Pile_C14三组转录组测序获得的clean reads中，能定位到基因组上的reads片段有135 603 695个，占比78.89%~82.5%，在参考序列上有多个比对位置的reads片段有1 627 747个，占比0.93%~1.04%，在参考序列上有唯一比对位置的reads片段有133 975 948个，占比77.84%~81.58%，比对到基因组上正链的reads片段有66 778 656个，占比38.69%~40.67%，比对到基因组上负链的reads片段有67 197 292个，占比39.16%~40.91%。能定位到基因组上的reads片段中，分段比对到两个外显子上的reads片段有61 654 288个，占比35.45%~37.83%，整段比对到外显子的reads片段有72 321 660个，占比41.63%~43.74%。