《表3 RNA-seq测序参考序列比对情况》

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《基于转录组测序技术观察电针对2型糖尿病小鼠血浆外泌体circRNA表达的影响》

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经过图像识别和碱基识别后，从Illumina HiSeq测序仪上收获原始reads。使用cutadapt软件去接头，去低质量reads，获得高质量reads。使用STAR软件将clean reads比对到小鼠参考基因组（UCSC MM10）上，并以Ensembl转录组（v75）gtf文件为指导，使用DCC软件进行circRNA检测。测序产出数据质量显示，过滤后数据中的碱基数（clean reads）数据为5.5～6.5 G，错误率为0.01～0.02，Q30（碱基正确识别率为99.9%）>80%，G、C碱基含量在正常范围内。本研究的3组样品过滤后与参考基因组进行比对，比对到基因组上读段数的比例均高于78%（一般高于70%），比对到多位置的读段数比例均低于5%（一般低于10%），是后续分析内容的基础。与参考基因组比对的具体情况见表3。