《表1 中华按蚊雌、雄蚊转录组测序质量检测、参考基因组比对情况》

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《中华按蚊雌、雄蚊转录组比较分析》

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注：RR，CR，CB，Q20，Q30和TM的含义见正文；MA表示雄蚊，FA表示雌蚊，下同

用从中华按蚊雌、雄蚊提取的总RNA制备了6个RNA-Seq文库，并通过Illumina Hiseq平台进行测序。6个样本共产生了超过3.23×108条原始测序数据（Raw reads，RR），经过质量评估和过滤，在去除含有测序接头、未知碱基“N”以及低质量的Reads后，得到约3.19×108条过滤后的数据（Clean reads，CR），共含碱基个数为47.79×109。每个样本的CR范围为4.45×107～5.90×107条，高质量的Reads碱基总数（Clean bases，CB）范围为6.68×109～8.48×109个。各样本的测序过程碱基识别准确率达到99%以上的碱基占总碱基数的百分比（Q20）大于或等于97.59%；而各样本的测序过程碱基识别准确率达到99.9%以上的碱基占总碱基数的百分比（Q30）大于或等于93.17%。此外各样本的GC碱基对的比例在46.74%以上，说明各样本的基因相对较稳定。各样本实验所产生的测序序列比对个数（Total mapped，TM）范围为4.05×107～5.43×107；它们占CR的平均值为92.40%，大于70%，满足有参分析要求（表1）。测序共得到了20 131个基因，用FPKM值对基因表达水平进行标准化，各样本不同基因表达水平区间的基因数量和占样本基因总数的比例如表2所示。