《表2 样品测序数据评估:大白菜雌不育突变体fsm花蕾激素代谢的转录组分析》

《表2 样品测序数据评估:大白菜雌不育突变体fsm花蕾激素代谢的转录组分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《大白菜雌不育突变体fsm花蕾激素代谢的转录组分析》


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利用Illumina平台对构建好的野生型FT和雌不育突变体fsm转录组文库进行高通量测序。经过去除接头、污染和低质量的序列,分别从FT和fsm的3次生物学重复中共获得130,216,688个和134,955,118个clean reads。使用TopHat2软件将得到的clean reads比对到大白菜数据库,获取在参考基因组或基因上的位置信息。比对结果统计显示(表2),各样品clean reads与参考基因组的比对概率在53.95%~61.52%,唯一比对到参考序列的数量为52.05%~60.11%。测序数据量和质量均较好,可以用于后续序列组装和分析。