《表2 测序数据统计分析:玉米C型细胞质雄性不育花药不同发育时期的转录组分析》
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《玉米C型细胞质雄性不育花药不同发育时期的转录组分析》
CR:恢复系;Cr:不育系;Nr:保持系;M1:中期Ⅰ;P1:前期Ⅰ;T2:四分体时期(末期Ⅱ);下同。样品名最后一位数字:重复
为减少分期播种的环境影响及不同个体间的差异,同一时期至少混合3个不同播期材料及3个单株上的样品用于RNA提取及后续测序分析。所测数据经过严格的质控后,产生5.6亿对双末端序列,共计156.59 Gb的序列数据(表2)。除样品Cr T23和CRT23外,Q30比例都超过了90%。PCA分析显示三系前期各有一个样品与相同时期的样品差异较大,在后续比对分析中被剔除;其余不同样品间差异明显,不同样品的生物学重复可聚类在一起。Hisat2比对到参考基因组的序列经过stringtie组装,共得到53 035个Unigene,其中20 017(37.74%)个Unigene为B73基因组中未注释的新基因。
图表编号 | XD0048698100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.16 |
作者 | 薛亚东、杨露、杨慧丽、李冰、林亚楠、张怀胜、郭战勇、汤继华 |
绘制单位 | 河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、河南农业大学农学院、省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室、长江大学主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心 |
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