《表2 测序数据统计:不同品种茶树新梢响应“倒春寒”的转录组分析》
注:LJ43_CK:未受冻害的龙井43新梢;LJ43_CS:受冻害的龙井43新梢;ZC126_CK:未受冻害的中茶126新梢;ZC126_CS:受冻害的中茶 126 新梢。下同 Note: LJ43_CK: unfrozen shoots of LJ43. LJ43_CS: frozen shoots of LJ43. ZC126_CK: unfrozen shoots of ZC126. ZC126_CS: fro
本次试验共构建了4个cDNA文库,根据每个文库下机数据的碱基错误率、高质量reads数目和数据量统计结果(表2),结合单碱基质量分布图、碱基含量分布图,以及reads平均质量分布,表明本次RNA-seq测序错误率小、单碱基质量高、无AT/CG分离。Clean reads与舒茶早茶树参考基因组的比对结果显示,各样品的clean reads与参考基因组的比对率达到79%,其中在基因组上比对位置单一的clean reads中,比对至基因外显子区域的reads数占比高于85%,结合测序reads在基因上覆盖度的分布情况,说明本次RNA-seq的reads整体测序质量好、与参考基因组的比对率高,符合后续分析要求。
图表编号 | XD0029516300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.15 |
作者 | 王君雅、陈玮、刘丁丁、陈亮、姚明哲、马春雷 |
绘制单位 | 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室、中国农业科学院研究生院、中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室、中国农业科学院研究生院、中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室、中国农业科学院研究生院、中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室、中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室、中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中 |
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