《表1 RT-qPCR引物序列》

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《不同品种茶树新梢响应“倒春寒”的转录组分析》


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为确保转录组数据的可靠性,我们共选取了18个可能参与低温响应的差异基因进行实时荧光定量PCR(Real time quantitative PCR,RT-qPCR)验证,相关基因编码蛋白涵盖了催化酶类、转录因子和结构蛋白等,通过Premier Primer5软件设计RT-qPCR引物(表1),引物序列由北京擎科新业生物技术有限公司合成。通过FastKing gDNA Dispelling RT SuperMix反转录试剂盒将RNA反转录成cDNA,统一稀释至终浓度10 ng·?L-1。采用相对定量的方法,以GADPH为内参基因,正常新梢为对照(CK),RT-qPCR的反应体系为2×SYBR Green Master 5?L,cDNA模板1.5?L,上下游引物各0.4?L,加灭菌水至终体积10?L。反应程序为:95℃预变性10 min;94℃变性10 s,58℃退火15 s,72℃延伸12 s,反应进行40个循环;3次技术重复,采用2-(35)(35) CT算法计算基因的相对表达量。