《表2 注释统计分析:银鲴肝脏转录组测序和功能分析》
将银鲴转录组测序筛选所得的Unigene序列与数据库进行比对和注释(表2)。依据各数据库注释的Unigene序列数量和比例,可知各数据库由于筛选条件不同成功注释的基因数也不同。其中以Nr数据库成功注释的Unigene序列最多,达25 738条,占59.38%,这与其采用序列相似性比对搜索有关。COG数据库注释的信息最少,仅有6 725条,占15.51%。在所有注释成功的Unigene中,与Nr库比对上的物种间相比,银鲴与斑马鱼(Danlo rerio)的基因相似度最高,达78.12%(图1)。这主要是由于两者都属于鲤科鱼类且斑马鱼作为模式生物其基因数据最为丰富。
图表编号 | XD00156623400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.25 |
作者 | 彭新亮、刘俊、赵良杰、郭旭升 |
绘制单位 | 信阳农林学院、河南省渔业生物工程技术研究中心、信阳农林学院、信阳农林学院、河南省渔业生物工程技术研究中心、信阳农林学院、河南省渔业生物工程技术研究中心 |
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