《表2 七彩神仙鱼脑组织转录组测序注释统计结果》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《七彩神仙鱼脑组织转录组mRNAs差异表达分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

利用Illumina Hi Seq 6000平台对构建的七彩神仙鱼脑组织c DNA文库进行测序分析，结果在6个c DNA文库中共获得337190200条Raw reads；经质量筛选后获得34109个基因（平均长度1007.00 bp）和67488个转录本（平均长度694.00 bp）。将34109个基因输入NR、GO、KEGG、Pfam、Swiss-Prot和egg NOG等数据库中进行比对，结果（表2）显示，在NR数据库中共比对出16220个基因（占47.55%），比对得到序列最多的是尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）（占30.04%），其次是斑马拟丽鱼（Maylandia zebra）（占9.61%）和新亮丽鲷（Neolamprologus brichardi）（占7.34%），说明七彩神仙鱼转录组测序比对得到亲缘关系最近的物种是罗非鱼。在egg NOG数据库中共比对出15242个基因（占44.69%），发现大量基因参与细胞运输、囊泡运输、信号转导、蛋白质翻译及转录等过程。在GO数据库中共比对出13624个基因（占39.94%），分别包含在25个生物过程（Biological process）、15个细胞组成（Cellular component）和10个分子功能（Molecular function）中（图1）。在生物过程中，以参与生化过程、DNA模板转录调节、发育过程及信号传导过程的基因最多；在细胞组成中，以参与细胞膜及膜组成的基因最多；在分子功能中，则以参与金属离子结合、分子功能及ATP结合过程的基因最多。