《表1 测序数据质量分析:基于转录组测序的方斑东风螺单核苷酸多态性位点挖掘及功能注释》

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《基于转录组测序的方斑东风螺单核苷酸多态性位点挖掘及功能注释》


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用Illumina高通量测序平台对方斑东风螺足组织进行转录组测序,对原始数据进行严格的质量控制,经过滤后在对照组转录组(BLANK)和实验组转录组(LPS-4h、LPS-8h组)分别获得56 424 638、50 596 990、49 924 362条纯净序列,其中GC比例分别为47.8%、46.15%、46.88%,碱基质量值Q30分别为95.40%、95.61%、95.40%(表1)。说明方斑东风螺测序质量较高,转录组数据可用于后续分析。