《表1 测序数据统计结果:基于转录组测序的木薯性别决定相关基因挖掘》
Raw data经过滤去杂后,共得到64189053条Clean reads,高质量碱基19.29 Gb,每个样品的高质量碱基均在6.30 Gb以上。3种花蕾的GC含量均在43.00%左右、Q30均在95.00%左右(表1),表明测序质量良好。将测序数据与参考基因组序列进行比对,结果如表2所示。木薯雄蕾、雌蕾和两性蕾对比到参考基因组上的Clean reads分别为42642272、42172402和43563432条,其中,参考基因组和单端的比对率均在77.00%左右、多位置比对率均小于0.80%,正、负链比对率均在39.00%左右,表明试验污染少、测序数据质量较好。从比对序列分布情况看,约有90.00%序列定位于外显子,仅有5.00%左右的序列定位于内含子和基因间区。序列比对到内含子和基因间区分别是由于m RNA前体、发生可变剪切的内含子保留或基因组注释不完善所致。
图表编号 | XD00221212700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.30 |
作者 | 韦丽君、俞奔驰、宋恩亮、郑华、卢赛清、付海天 |
绘制单位 | 广西亚热带作物研究所、广西亚热带作物研究所、广西亚热带作物研究所、广西亚热带作物研究所、广西亚热带作物研究所、广西亚热带作物研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |