《表2 测序数据统计结果:紫花苜蓿耐苏打盐碱相关基因的转录组学分析》

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《紫花苜蓿耐苏打盐碱相关基因的转录组学分析》


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如表2所示,对试验中的2个样品测序后分别获得了8千万余条原始序列数据,过滤后Clean data占原始序列数据95.24%和96.44%;碱基数占原始碱基数的88.23%和92.04%;两个样品碱基错误率分别由0.0378%降低到0.0268%和0.0238%到0.0184%,GC%含量变化不大。测序分析中把Q≥20的碱基作为高质量,本研究中Q20值在96.37%~90.15%之间。混合2个样品的高质量读段,用Trinity软件[18]进行从头组装,de novo组装后共得到91 853个Unigenes,每个Unigenes的长度为711.67bp。