《表1 采用二代测序技术 (NGS) 和宏基因组学分析发现的部分鱼类病毒》

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《宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用》

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2011年以来，应用二代测序和宏基因组学技术，鉴定了许多养殖和野生鱼类病毒，例如虹彩病毒科病毒[20]。在大西洋三文鱼[47]、淡水鲤鱼[48]和金体美洲鳊鱼[49]体内鉴定了呼肠孤病毒，在欧洲鲶鱼体内鉴定了圆环病毒[50]，在鲤鱼[51]和金体美洲鳊鱼[52]体内发现了小RNA病毒科病毒，在鲤鱼体内鉴定了微小核糖核酸病毒属病毒[53]，在白亚口鱼和大太阳鱼体内鉴定了嗜肝DNA病毒[54-55]，在金体美洲鳊鱼体内鉴定了整体病毒科病毒[56]，在钓饵鱼体内鉴定了黑头豆科杯状病毒[57]。这些基于二代测序和宏基因组学鉴定的鱼类病毒案例的详细信息见表1。