《表2 通用引物序列:高通量二代测序基因条形码技术在动物源性制品物种鉴定中的应用》
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《高通量二代测序基因条形码技术在动物源性制品物种鉴定中的应用》
首先根据动物线粒体全长基因寻找两端序列具有足够保守而中间序列具有高种间区分度的区域进行通用型引物设计并进行后续实验优化。根据后续二代测序平台的特点,PCR产物的长度控制在350 bp左右,这样既保证了足够的物种特异性信息量,也确保靶基因长度符合NGS平台片段读取长度限制。与此同时,通过筛选试验进一步确保该引物对不同物种核酸具有基本相似的扩增效率。本研究重新设计、合成、优化、筛选了该通用引物对。在理论上,利用NCBI在线生物信息学软件工具(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)进行序列搜索和比对。结果表明,该引物能有效扩增常见哺乳动物、鸟类和鱼类的核酸。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
图表编号 | XD00157519900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.20 |
作者 | 蔡一村、林颖峥、刘群秀、王强、张强、熊炜、袁耀华、潘良文 |
绘制单位 | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、上海动物园、上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、上海海关动植物与食品检验检疫技术中心、上海动物园、上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 |
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