《附录2 病毒宏基因组学分析病毒序列注释》

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《贵州省四种蝙蝠携带病毒组》


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√及括号内数字表示:经序列比对确定的人畜共患型病毒种类;NR:将基因序列与NR数据库比对后获得的具有注释信息的序列数量;NT:通过NT数据库进行病毒序列比对所获得的序列数量;——:只鉴定到科级单位,未能确定到种。

本研究共采集到10个蝙蝠物种,但只有4种检测到病毒,另外6种经多次检测,都依然没有检测出病毒。存在原因可能是,在野外简陋的取样环境下容易导致组织样品受污染,病毒RNA或DNA被降解;由于野外采样交通不便耗时长,对新鲜样品的保存条件十分有限。因此,检测到的病毒主要集中在蹄蝠科、菊头蝠科2科的大蹄蝠、三叶蹄蝠、贵州菊头蝠、皮氏菊头蝠4种蝙蝠,结合病毒宏基因组和s RNA的检测结果发现,蹄蝠科和菊头蝠科共同携带8个属病毒,如禽痘病毒属(Avipoxvirus)、瘟病毒属、戊型肝炎病毒属、单纯疱疹病毒属等(附录2、3);所检测到的病毒中,痘病毒科(Poxviridae)、疱疹病毒科、肝炎病毒科、拟菌病毒(Mimiviridae)为人畜共患型病毒,不同蝙蝠物种均携带多种人畜共患型病毒,对疾病的传播存在极大的潜在风险。同时,4种蝙蝠均检测到脊椎动物病毒、昆虫病毒、植物病毒、细菌病毒4类病毒。由于粪便样品只有大蹄蝠组检测成功,将蹄蝠科的大蹄蝠组粪便样品检测结果与2种菊头蝠科蝙蝠及三叶蹄蝠的组织样品检测结果比较发现,粪便样品中检测到的细菌病毒远高于其他病毒,其原因可能在于,肠道微生物丰富度更高;粪便样品暴露在自然环境下,易受到外源细菌污染。组织样品检测到更多的脊椎动物病毒。粪便样品检测出更多人兽共患型的病毒种类,如沙粒病毒科(Arenaviridae)、披膜病毒科(Togaviridae)、呼肠孤病毒科(Reoviridae)、黄病毒科、腺病毒科、乳头状瘤病毒科(附录2、3),这可能和贵州多数地方村民都习惯将牲畜饲养在洞穴中有关,这种人为活动为病毒在不同宿主间的交叉传染提供了条件。