《表2 引物序列:罗布麻黄酮醇合成酶基因克隆及其生物信息学分析》

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《罗布麻黄酮醇合成酶基因克隆及其生物信息学分析》


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按照Ultrapure RNA Kit(DNaseⅠ)(超纯RNA提取试剂盒(DNaseⅠ)操作说明提取总RNA。按照PrimeScript 1stStrand cDNA合成试剂盒说明书合成cDNA。通过对已知植物FLS核苷酸序列进行同源性比对分析,找出高度保守区域,利用DNAMAN 6.0和Primer 6.0,根据简并性低和同源性高的原则,设计一对简并引物P1和P2(表2),扩增AvFLS基因的核心片段,PCR反应条件为:94℃预变性60 s,98℃变性10 s,55℃退火15 s,68℃延伸60 s,35个循环,最后72℃延伸10 min。根据所得的核心片段设计5'端特异引物P3(外侧引物)、P4(巢式引物)以及3'端特异引物P5(外侧引物)、P6(巢式引物),分别与试剂盒提供的引物(P7,P8)(表2) 进行配对,用于外侧和巢式PCR扩增,外侧PCR反应条件为:94℃预变性60 s,98℃变性10 s,55℃退火15 s,72℃延伸60 s,30个循环,最后72℃延伸10 min。巢式PCR反应条件为:94℃预变性60 s,98℃变性10 s,55℃退火15 s,68℃延伸60 s,30个循环,最后72℃延伸10 min。PCR产物用1%的琼脂糖凝胶检测,回收纯化的产物连接到T-vector p MD19载体,转化DH5α感受态细胞,阳性克隆送至苏州金维智测序,将测序得到的片段拼接得到AvFLS的全长c DNA,用DNAMAN 6.0预测ORF区,设计全长引物P9、P10(表2),通过PCR扩增得到目的条带,经回收纯化送苏州金维智测序。