《表2 第二代、第三代宏基因组测序技术特点》
对宏基因组的测序分析,目前主要有Sanger/鸟枪法和高通量测序技术(High-throughput sequencing)。高通量测序技术又称第二代测序技术,目前主要代表平台有Roche 454焦磷酸测序(Pyrosequencing)、Illumina Solexa合成测序、ABI SOLiD连接法测序等[30]。利用这些平台对动物体内(例如淡水鱼类)及养殖水环境[39]、废水以及废水接收河水[40],甚至是人体(例如人类肠道)[1]中存在的ARGs进行测序,探索ARGs在环境中的传播机制以及对人类健康的潜在影响。随着人们对高通量测序的进一步研究,被称为第三代测序技术的Helicos单分子测序、Pacific Bioscience的SMRT(Single molecule real-time)技术和Oxford Nanopore Technologies公司的纳米孔单分子测序技术正向着高通量、低成本、更长的读取长度发展[31]。测序技术的快速进步推动了宏基因组学的发展,本文对第二代以及第三代测序技术的特点进行比较(表2)[32,42-43]。
图表编号 | XD00112485700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.20 |
作者 | 胡海燕、刘慧敏、孟璐、董蕾、兰图、郑楠、程建波、王加启 |
绘制单位 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部奶产品质量安全风险评估实验室(北京)、安徽农业大学动物科技学院、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部奶产品质量安全风险评估实验室(北京)、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部奶产品质量安全风险评估实验室(北京)、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重点实验室、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业农村部奶产品质量安全风险评估实验室(北京)、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物营养学国家重 |
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