《表2 数据统计:基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析》
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《基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析》
注:Valid ratio(reads):高质量序列read数占Reads总数的百分比;Q20:碱基识别准确率在99%以上的碱基所占百分比;Q30:碱基识别准确率在99.9%以上的碱基所占百分比;0 d:接种叶锈菌0 d后的小麦材料TcLr19;1 d:接种叶锈菌1d后的小麦材料TcLr19;6 d:接种叶锈菌6 d后的小麦材
通过对各样品的转录组测序数据的分析,分别获得Raw reads 48 258 292、47 346 190和56 341 268条,数据经过去除接头和质量过滤后,与原始数据相比,有效数据量均高于99%。各样品中GC含量均为58%以上,Q20值均高于98%(表2)。以上分析结果表明,各样品的RNA样本测序所得原始数据的碱基组成基本平衡,且大部分reads的碱基质量值大于20,符合数据质量错误率低于1%的要求,说明测序质量较好,数据具有可靠性。
图表编号 | XD00129895800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 张艳俊、杨毅清、袁心悦、王海燕、刘大群 |
绘制单位 | 河北农业大学植物保护学院、河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、国家北方山区农业工程技术研究中心、河北农业大学植物保护学院、河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、国家北方山区农业工程技术研究中心、河北农业大学植物保护学院、河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、国家北方山区农业工程技术研究中心、河北农业大学植物保护学院、河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心、国家北方山区农业工程技术研究中心、中国农业科学院研究生院 |
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