《表1 样品测序数据统计:苗药八爪金龙转录组测序与次生代谢产物合成相关基因的挖掘》
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《苗药八爪金龙转录组测序与次生代谢产物合成相关基因的挖掘》
利用Illumina Hi Seq 4000测序平台对12个苗药八爪金龙根部样品进行转录组测序,共获得89.73 Gb高质量的clean reads,其Q30平均值达到95.05%,平均每个样品的GC含量占总碱基数的45.78%(表1)。利用Trinity对clean reads进行序列组装,共获得52 249条Unigenes,总长度为75 282 082 nt,平均长度为1440nt,N50为2336 nt,组装完整性较高。长度分布在300~500 nt的Unigenes最多,有15 065条,占Unigenes总数的28.83%;长度大于1000 nt的Unigenes有25 190条;长度大于2000 nt的Unigenes有13 283条,占Unigenes总数的25.42%。
图表编号 | XD00215775700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.03.12 |
作者 | 刘畅、俸婷婷、刘雄伟、丁晶鑫、石慧、潘婕、周英 |
绘制单位 | 贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药食两用资源应用与开发研究中心中药材开发技术研究中心、贵州中医药大学药学院药 |
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