《表1 样品测序数据统计:苗药八爪金龙转录组测序与次生代谢产物合成相关基因的挖掘》

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《苗药八爪金龙转录组测序与次生代谢产物合成相关基因的挖掘》


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利用Illumina Hi Seq 4000测序平台对12个苗药八爪金龙根部样品进行转录组测序,共获得89.73 Gb高质量的clean reads,其Q30平均值达到95.05%,平均每个样品的GC含量占总碱基数的45.78%(表1)。利用Trinity对clean reads进行序列组装,共获得52 249条Unigenes,总长度为75 282 082 nt,平均长度为1440nt,N50为2336 nt,组装完整性较高。长度分布在300~500 nt的Unigenes最多,有15 065条,占Unigenes总数的28.83%;长度大于1000 nt的Unigenes有25 190条;长度大于2000 nt的Unigenes有13 283条,占Unigenes总数的25.42%。