《表1 各个样品转录组测序数据统计》

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《高pH胁迫下拟南芥根转录组学与网络应答》

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注：pH6＿WT表示野生型在pH 6.0培养基上处理，每个pH处理3个重复，pH8＿WT表示野生型在pH 8.0培养基上处理，每个pH处理3个重复。Note:pH6＿WT stands for wild type treated on pH 6.0 medium，with 3 replicates for each pH treatment，pH8＿WT stands for wild type treated

为确定高pH胁迫对拟南芥根转录水平的影响，将萌发后五天的拟南芥幼苗经对照（pH 6.0）和高pH(pH 8.0）培养基处理七天，分别取拟南芥总根进行转录组测序分析，每组三个生物学重复。对照组和高pH处理组测序的原始序列均为21.94 M；过滤掉接头和低质量的序列，对照组干净序列为21.86M、21.87 M、21.87 M，高pH处理组干净序列为21.87M、21.86 M、21.88 M；经序列拼接比对到参考基因组，其比对率分别为98.26%、98.3%、98.3%、98.28%、98.26%、98.27%（表1）。以上数据表明转录组测序质量较高，符合进一步生物信息学分析。