《表1 无参转录组测序的数据情况》
注:Raw reads:测序直接读取到的序列数量;Clean reads:Raw reads去除接头和低质量序列后的合格序列数量;Mapped reads:能比对到参考序列的序列数量;Gene number:比对到的基因的数量
通过双端150 bp测序(PE150),4组样品的转录组测序得到的原始数据(Raw reads)从50 309 938到59 393 342之间,有效数据(Clean reads)的比例均高于98.5%,GC含量从45.45%到46.02%不等。能比对到预组装的参考序列的Reads比例(Ratio of mapped reads to clean reads)从89.7%到90.61%之间不等,有效的基因数量(Gene number)从38 707到44 156之间(表1)。
图表编号 | XD00221210100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.25 |
作者 | 王茜、陈东奎、黄宏明、廖惠红、李一伟、刘福平、汪妮娜 |
绘制单位 | 广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心、广西壮族自治区农业科学院园艺研究所、广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心 |
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