《表1 转录组测序数据统计》
注:比对序列数:将每个样品的总碱基数与参考序列上的序列数做比对;比对率:比对到参考序列上的序列百分比
对北美鹅掌楸耐淹无性系和淹水敏感无性系淹水胁迫处理0和4 d的叶片进行转录组测序,获得201 817 794条Clean reads,总长30.27 G;碱基正确识别率达99%的Q20设置的高质量序列占96.16%,序列的N50值为1 421,表明本研究的转录组组装完整性较高,质量较好。拼接后获得395 733个参考转录本,214 161个Unigene,占总序列的80.76%,序列长度主要分布在300~2 000 nt之间,随着Unigene长度增加,Unigene数量逐渐减少。耐淹无性系在淹水0 d和4 d的c DNA文库分别有74.86%,73.93%的序列比对上参考转录本序列,淹水敏感无性系分别为74.41%、73.26%(表1)。
图表编号 | XD00194383600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 谭胤静、孙小艳、伍祎翌、李晓晖、辛在军 |
绘制单位 | 江西省科学院生物资源研究所、江西省科学院生物资源研究所、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心 |
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