《表1 转录组测序数据统计》

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《北美鹅掌楸淹水胁迫转录因子的鉴定及表达分析》


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注:比对序列数:将每个样品的总碱基数与参考序列上的序列数做比对;比对率:比对到参考序列上的序列百分比

对北美鹅掌楸耐淹无性系和淹水敏感无性系淹水胁迫处理0和4 d的叶片进行转录组测序,获得201 817 794条Clean reads,总长30.27 G;碱基正确识别率达99%的Q20设置的高质量序列占96.16%,序列的N50值为1 421,表明本研究的转录组组装完整性较高,质量较好。拼接后获得395 733个参考转录本,214 161个Unigene,占总序列的80.76%,序列长度主要分布在300~2 000 nt之间,随着Unigene长度增加,Unigene数量逐渐减少。耐淹无性系在淹水0 d和4 d的c DNA文库分别有74.86%,73.93%的序列比对上参考转录本序列,淹水敏感无性系分别为74.41%、73.26%(表1)。