《表3 全转录组测序数据的转录本类型》

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《苹果苦痘病果不同部位类黄酮含量及其差异表达基因分析》


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经文库构建和测序,从健康部分和病斑部位2组样品中分别获得237.059和244.174 M原始测序数据,包含35.559和36.626 Gb原始碱基,经净化和质量过滤,获得214.127和218.992 M净数据,包含30.547和31.455 Gb净碱基,其碱基百分比(Q30)为94.1%~94.8%(表2),说明转录组测序数据质量较高,可用于后续分析。miRNA文库构建与测序结果显示,总共获得了4 331 reads,与3 753个靶标基因相关联,这些靶标基因中,2 571个基因上调,1 181个基因下调。序列分析和注释结果显示,总共获得41 894个RNA,已知RNA和新RNA分别为15 852和26 042个(表3)。