《表1 转录组测序数据质量分析》

《表1 转录组测序数据质量分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于转录组测序的硒处理银杏萜类合成的关键基因表达分析》


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通过Illumina Hi Seq测序后获得447 207 439条Raw reads,过滤去除低质量片段后获得431 640 524条Clean reads。各样品的GC含量平均值为47.64%,且碱基质量超过Q30的比例均在90%以上,说明转录组测序质量和数据量相对较高,符合后续分析要求(表1)。由于无参考基因组,因此获得Clean reads后,采用Trinity对Clean reads进行拼接组装,取每条基因中最长的转录本作为Unigene为后续分析。拼接组装后获得142 834条Unigene,平均长度为656 bp (表2)。