《表2 斑节对虾转录组测序数据产出质量》

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《基于转录组学的养殖密度影响斑节对虾品质的分子机制》

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注：M1＿1、M1＿2、M1＿3表示养殖密度100尾/m2斑节对虾样品的3次生物学重复；M3＿1、M3＿2、M3＿3表示养殖密度300尾/m2斑节对虾样品的3次生物学重复；Q20.测序碱基质量值（Phred）数值大于20的碱基占总体碱基的百分比；Q30.Phred数值大于30的碱基占总体碱基的百分比。下同。

将原始序列（Raw Reads）作为原始数据文件，通过CASAVA Base Calling软件进行分析。因为原始序列包含接头和低质量的序列，为了确保测序结果分析的准确性，必须对原始序列进行过滤，获得Clean Reads。随后的生物信息学分析都基于Clean Reads。测序数据的质量如表2所示。