《表2 翘嘴鳜极大个体和极小个体转录组测序数据产出及拼接结果汇总》

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《全同胞家系中生长差异翘嘴鳜肌肉转录组分析》

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经Illumina测序后，两个翘嘴鳜转录组样本共获得95581082条raw reads，其中极大个体组48963598条，极小个体组46617484条；经过筛选去除低质量序列后，共得到91264026条clean reads，平均长度约为100 bp，占总reads数的95.48%；测序结果中GC含量为51.31%，Q20百分比为98.57%，具有良好的测序质量，两个转录组本间无显著数据量差异，可用于分析两个转录本表达模式差异。经Trinity拼接组装后，两个转录本共得到73353条Unigene，平均长度为703 bp（表2）。在去除短序列和重复序列之后，经过Nr、SwissProt、KEGG和COG4个数据库共定义39005条Unigene。Nr、COG、Swissprot及KEGG分别定义了38833条、10926条、33749条和19791条Unigene，确定Unigene序列方向后，通过定义最多Unigene数量的Nr数据库进行注释（图1）。