《表4 翘嘴鳜极大个体和极小个体差异表达基因通路分析》

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《全同胞家系中生长差异翘嘴鳜肌肉转录组分析》


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肌肉中大量组成成分是蛋白质,鱼类的生长与蛋白合成及消化紧密相关。KEGG聚类结果显示,富集差异表达基因最多的通路是内质网蛋白加工(protein processing in endoplasmic reticulum)、泛素调节的蛋白质降解(ubiquitin mediated proteolysis)以及RNA转运(RNA transport),分别是119条(3.77%)、101条(3.2%)和91条(2.88%)差异表达基因(表4)。RNA转运是细胞基因表达的基础,而内质网蛋白质加工则帮助蛋白质的正确折叠,并对错误折叠的蛋白质进行降解,是蛋白生成的基础。与差异表达基因趋势一致,在小个体翘嘴鳜中大部分基因表达量更高,具有更活跃的表达模式。泛素调节的蛋白质降解通路是蛋白质降解的重要途径,通过与酶结合后产生级联反应达到蛋白质降解的目的[24]。本研究中小个体翘嘴鳜蛋白质降解通路表达量增加,蛋白质积累减少,具有更低的生长率。其他鱼类研究显示,智利羽鼬鳚(Cenypterus chilensrs)在应激条件下,泛素调节的蛋白质降解具有更高的基因表达,也证实了在应激条件下,鱼类的低生长率与蛋白质合成代谢有关[25]。