《表4 根据GO和KEGG信号通路富集分析游泳相关的差异表达基因》
对差异表达基因的KEGG代谢通路富集分析,得到了美国红鱼应对流速胁迫的一些相对基因。如Hedgehog信号通路(Hedgehog signaling pathway)中Hh、PKA、CK1、Wnt等基因表现为上调、RNA降解(RNA degradation)中的Dcp1、EDC3基因表现为下调,而TOB基因则表现为上调;甾类激素生物合成(steroid hormone biosynthesis)过程中的17beta-estradiol 17-dehydrogenase酶、testosterone 17beta-dehydrogenase(NADP+)酶会表现下调,葡萄糖醛酸转移酶(glucuronosyltransferase)等酶表达量会表现上升、组氨酸的代谢(histidine metabolism)过程中的aldehyde dehydrogenase(NAD+)、组氨酸解氨酶(histidine ammonia-lyase)、天冬酰转移酶(aspartoacylase)表达量会表现上升。通过GO功能富集分析与KEGG信号通路富集分析,得到了美国红鱼在流速胁迫下与运动和疲劳有关的基因,同时对比了在胁迫下与正常情况下这些基因在肝脏中表达的不同。具体实验结果如表4。
图表编号 | XD0039530400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.01 |
作者 | 娄宇栋、冯建、何娇娇、晁帅、王萍 |
绘制单位 | 浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、浙江海洋大学海洋科学与技术学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室、宁波大学海洋学院 |
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