《表4 根据GO和KEGG信号通路富集分析游泳相关的差异表达基因》

《表4 根据GO和KEGG信号通路富集分析游泳相关的差异表达基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《流速胁迫对美国红鱼的转录特性研究》


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对差异表达基因的KEGG代谢通路富集分析,得到了美国红鱼应对流速胁迫的一些相对基因。如Hedgehog信号通路(Hedgehog signaling pathway)中Hh、PKA、CK1、Wnt等基因表现为上调、RNA降解(RNA degradation)中的Dcp1、EDC3基因表现为下调,而TOB基因则表现为上调;甾类激素生物合成(steroid hormone biosynthesis)过程中的17beta-estradiol 17-dehydrogenase酶、testosterone 17beta-dehydrogenase(NADP+)酶会表现下调,葡萄糖醛酸转移酶(glucuronosyltransferase)等酶表达量会表现上升、组氨酸的代谢(histidine metabolism)过程中的aldehyde dehydrogenase(NAD+)、组氨酸解氨酶(histidine ammonia-lyase)、天冬酰转移酶(aspartoacylase)表达量会表现上升。通过GO功能富集分析与KEGG信号通路富集分析,得到了美国红鱼在流速胁迫下与运动和疲劳有关的基因,同时对比了在胁迫下与正常情况下这些基因在肝脏中表达的不同。具体实验结果如表4。