《表3 基因模块的GO功能和KEGG通路富集分析》
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《基于GEO数据库对儿童哮喘急性发作靶基因的生物信息学分析》
将78个DEGs上传至STRING数据库,最终获得由31个节点和33条边参与构建的PPI网络(图4)。使用MCODE插件从中鉴定出的重要基因模块由5个节点和9条边构成(图5),提示我们从DEGs中共鉴定出5个关键基因:HLA-DPB1、HLA-DQB1、HLA-DQB2、MT2A和KIF11。对该模块基因进行GO功能和KEGG通路富集分析发现,在BP组中,其主要富集在γ干扰素介导的信号通路、通过MHCⅡ类分子进行抗原加工和外源性抗原肽的呈递、通过MHCⅡ类分子进行抗原加工和抗原肽的呈递;在CC组中,其主要富集在MHCⅡ类蛋白复合物、内质网膜腔侧、内质网膜腔侧组成部分;在MF组中,其主要富集在MHCⅡ类受体活性、抗原肽结合、跨膜信号受体活性;在KEGG通路富集中,其主要与哮喘、移植物抗宿主病、同种异体排斥反应等通路相关(表3)。
图表编号 | XD00209017200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.28 |
作者 | 张迪、姜凡、刘璐佳、景伟超、王有鹏 |
绘制单位 | 黑龙江中医药大学第二临床医学院、黑龙江中医药大学第二临床医学院、黑龙江中医药大学附属第二医院、黑龙江中医药大学附属第二医院、黑龙江中医药大学附属第二医院 |
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