《表1 功能模块差异基因KEGG通路富集分析》
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《非特指型外周T细胞淋巴瘤基因芯片表达谱GEO数据库挖掘分析》
将差异基因导入STRING网站,分析数据导入cytoscape3.6.1软件绘图,由软件自带的绘图工具绘制,删除远离网络中心的节点,形成含有230个蛋白节点,1 100个蛋白或作关系的网络图(图3),采用MCODE插件构建2个最显著相关的功能模块:MCODE1(Score=25),MCODE2(Score=18.667)。分别对2个功能模块进行KEGG通路富集分析,结果表1示,主要与趋化因子、NF-κB、PI3K-Akt、RAS以及细胞周期通路相关。采用cytoHubba插件,分别用degree、MCC、MNC评分标准,结合上述功能模块的组成基因,筛选出关键基因:CDK1、CCNB1、CXCR4、CDC20、CCR1和CXCL12。
图表编号 | XD006149300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.14 |
作者 | 李喆、谭晓虹、王明月、孙洁、柯晴、岑洪 |
绘制单位 | 广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科、广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科、广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科、广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科、广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科、广西医科大学附属肿瘤医院淋巴血液肿瘤科 |
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