《表1 上调差异表达基因的BP及KEGG通路富集分析》
用DAVID分别对上调和下调差异表达基因进行GO和KEGG富集分析。得到了Biological process (BP)和KEGG pathway结果(表1、2)。上调基因BP功能聚类主要集中在“positive regulation of c AMP biosynthetic process”,“synaptic transmission,cholinergic”,“cation transmembrane transport”,“regulation of membrane potential”等。有3种典型的KEGG通路在上调基因中过表达,包括“Neuroactive ligand-receptor interaction”,“Nicotine addiction”和“GABAergic synapse”。下调基因BP功能主要富集在“potassium ion transport”,“energy reserve metabolic process”和“oxygen transport”等,下调基因在KEGG通路中主要富集在“Salivary secretion”,“c AMP signaling pathway”和“Cardiac muscle contraction”等。由此可见,差异表达基因功能主要富集在与某些神经内分泌调节有关的生物学过程和通路中,通过膜电位改变,跨膜离子的转运和突触传递等影响患者5年生存率。
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绘制时间 | 2020.10.30 |
作者 | 李树强 |
绘制单位 | 中国医科大学附属盛京医院普通外科 |
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