《表3 缺氧时三维培养脑皮质细胞差异表达基因KEGG信号通路富集分析》
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《缺氧对三维培养脑皮层细胞基因表达及信号通路的影响》
注:本表仅列出P<0.05的信号通路富集情况
KEGG数据库主要用于从分子水平,特别是高通量分析产生的大规模数据集中了解生物系统的高级功能及主要通路。通过使用KEGG软件对高、低差异表达基因进行信号通路富集分析,发现缺氧上调基因在内质网蛋白加工、糖/氨基酸代谢及缺氧诱导因子1(HIF1)等信号通路高度富集,而下调基因主要富集在帕金森病通路(表3)。蛋白互作分析结果显示,与内质网蛋白加工相关基因中有29个基因(29/30)可相互作用(图3 A);糖酵解通路相关的1 4 个基因(1 4/1 4)形成网络(图3B);与HIF1通路相关的16个基因(16/16)均可形成互作网络(图3C)。而帕金森病通路相关的7个下调基因中有6个可相互作用,且这些基因均与线粒体功能相关(图3D)。这些结果进一步说明缺氧引起的蛋白质折叠及代谢异常可能是缺氧性脑损伤的主要原因。
图表编号 | XD0085653400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.20 |
作者 | 程娜、田领章、刘炜 |
绘制单位 | 河南省儿童医院,郑州大学附属儿童医院血液肿瘤科、河南省夏邑县妇幼保健院儿科、河南省夏邑县妇幼保健院儿科、河南省儿童医院,郑州大学附属儿童医院血液肿瘤科 |
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