《表2 缺氧时三维培养脑皮质细胞差异表达基因的生物过程富集分析》

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《缺氧对三维培养脑皮层细胞基因表达及信号通路的影响》

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注:本表仅列出缺氧上调/下调基因生物过程富集情况的前10位

为进一步明确缺氧主要可引起哪些生物学过程异常，使用Gene Oncology对差异表达基因主要参与的生物过程进行富集分析。表2所示，缺氧上调基因与内质网应激反应、内质网蛋白质折叠、氧化还原过程及多种糖代谢途径密切相关；下调基因主要参与神经系统的发育以及细胞分化过程。为进一步发现主要关键基因，使用String及Cytoscape软件对主要生物过程相关基因进行蛋白互作分析。上调基因中与内质网应激反应相关的36个基因（36/43）可相互作用，与内质网未折叠蛋白反应相关的24个基因（24/28）可形成互作网络（图2A、2B）。而参与多细胞生物发育过程中的78个下调基因主要形成三个互作网络，分别含有29个基因、7个基因、6个基因（图2C）。与神经系统发育相关的48个下调基因主要形成2个子网络，分别含19个基因和6个基因（图2D）。以上结果提示，缺氧造成的脑损伤可能主要通过诱导细胞内质网应激反应、蛋白质错误折叠及干扰神经细胞的发育引起。