《表2 KEGG分析共同差异表达上调基因的生物信号通路》

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《子宫内膜癌淋巴结转移相关基因的生物信息学分析》

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对GSE39099和GSE2109数据集通过GEO2R进行差异表达基因筛选。本研究以P<0.05和2倍变化阈值为条件进行严格筛选，在GSE39099芯片中共筛选出1 272个上调及2 127个下调差异表达基因；在GSE2109芯片中共筛选出1 570个上调及1 540个下调差异表达基因。将GSE39099和GSE2109芯片中的上调和下调基因分别采用Venn作图工具继续筛选，发现140个共同上调和424个共同下调差异表达基因。2.1.3生物信号通路分析对于上述140个共同上调和424个共同下调差异表达基因，采用DAVID软件对京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）数据库进行生物信号通路（pathway）富集分析，并统计每一条基因富集信号通路的P及FDR值。生物信号通路分析可寻找富集共同差异表达基因的信号通路，推断出与不同的组织样本差异表达基因相关的细胞信号通路，根据P<0.05筛选出差异显著的信号通路（表2、3）。