《表2 氨氮代谢相关差异表达基因KEGG富集通路》

《表2 氨氮代谢相关差异表达基因KEGG富集通路》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《枯草芽孢杆菌对氨氮应答的转录组及sRNA分析》


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采用软件Goatools对差异表达基因进行GO富集分析,获得差异表达基因主要具有的GO功能(图1)。上调基因中对与氨氮代谢功能有关的GO条目及候选基因进行筛选,共得到1个GO条目,包含37个DEGs。下调基因中GO条目及候选基因筛选共得到13个GO条目,包含574个DEGs。将DEGs标注到KEGG数据库中,对基因进行KEGG Pathway富集分析,结果显示,共富集到176个信号通路,上调基因与下调基因共同信号通路有130个。在差异基因KEGG富集结果中,挑选了富集最显著的20条通路在图形中展示(图2)。在所有KEGG通路中,对参与枯草芽孢杆菌氨氮代谢通路及候选基因筛选,共得到8个信号通路,包含260个DEGs (表2)。根据对差异表达基因GO与KEGG富集分析中筛选出9个与枯草芽孢杆菌R47对水中氨氮应答的相关基因(表3)。