《表4 在fsm与FT比较中差异表达基因显著富集最多的15条KEGG代谢通路》
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《大白菜雌不育突变体fsm花蕾激素代谢的转录组分析》
在本研究的转录组数据中,野生型FT中检测到32844个表达基因,突变体fsm检测到32660个表达基因。经过筛选,共鉴定出12729个差异表达基因,其中上调表达的基因6404个,下调表达的基因6324个。由表3可知,经GO功能聚类,将7020个差异表达基因注释到“细胞组分”类别中,7496个差异表达基因注释到“分子功能”类别中和7255个差异表达基因注释到“生物过程”中。差异显著的富集有:对内源性刺激的反应(909个)、非生物刺激反应(1045个)、细胞膜组分(1114个)、细胞膜(2464个)、细胞周边(637个)等。基于KEGG数据库,差异表达基因中有6921个基因比对到275条KEGG途径中。最富集的pathway为新陈代谢途径,其次是次生代谢物生物合成途径、植物-病原体互作和植物激素信号转导(表4)。
图表编号 | XD0042220600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.01 |
作者 | 刘文杰、黄胜楠、刘志勇、冯辉 |
绘制单位 | 沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院、沈阳农业大学园艺学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |