《表3 差异表达基因显著富集的代谢通路》

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《利用RNA-Seq发掘玉米叶片形态建成相关的调控基因》

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利用MapMan工具对差异表达基因进行pathway富集分析，差异基因被注释到125条代谢通路中，主要涉及生物合成、能量代谢、信号转导及次生代谢。以P-value≤0.05为筛选标准，发现这些基因显著富集到11条代谢路径（表3），其中核糖体路径富集差异基因数目最多达到83个，37个基因表达上调，46个基因下调表达；其次，植物激素信号转导通路富集57个差异基因，24个基因上调，33个基因下调；苯丙烷类代谢路径18个基因上调，15个基因下调；乙醛酸和二羧酸代谢通路15个基因上调，10个基因下调；谷胱甘肽代谢路径13个基因上调，10个基因下调；鞘脂类代谢路径2个基因上调，11个基因下调（表4）；油菜素内酯生物合成路径4个基因上调，3个基因下调（表5）；类黄酮生物合成路径6个基因上调，2个基因下调；苯并恶唑嗪类生物合成和苯乙烯类、二芳庚酸类、姜酚类生物合成通路也富集到较多差异基因，分别有7个和5个基因下调表达。基于不同代谢通路中基因上下调比例，推断核糖体、植物激素信号转导、鞘脂类代谢这些基因下调表达较多的路径可能与叶片发育，尤其是窄叶的形成密切相关。