《表2 根尖差异表达基因显著富集的前20个KEGG通路》

《表2 根尖差异表达基因显著富集的前20个KEGG通路》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于RNA-seq的水稻根尖和侧根区愈伤组织诱导中生长素相关基因差异表达分析》


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对根尖和侧根区中差异表达基因进行KEGG分析,根据显著分析的P值(KEGG富集分析统计学显著水平)选取了前20个KEGG通路。根尖上调表达的基因中富集最显著的是植物激素信号转导通路,其次是过氧化物酶体等通路;根尖下调表达的基因富集的通路有DNA复制、柠檬酸循环等(表2)。侧根区上调表达基因富集的KEGG通路有:DNA复制、错配修复、同源重组等DNA复制相关的通路,RNA相关的RNA运输、RNA聚合酶、RNA降解等通路,以及植物激素信号转导、油菜素类固醇生物合成等激素调控相关的通路;侧根区下调表达的基因显著富集在光合作用等通路(表3)。以上数据结果显示,CIM诱导24 h后根尖和侧根区上调表达的基因均富集在植物激素信号转导通路,表明高浓度生长素诱导的愈伤组织形成初期,水稻根细胞中植物激素对基因表达产生了明显的调控作用。