《表5 差异表达基因富集最显著的前20个KEGG通路》

《表5 差异表达基因富集最显著的前20个KEGG通路》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯对罗非鱼肝脏转录组影响研究》


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将差异表达基因按照生物过程(Biological proeess)、细胞组分(Cellular component)和分子功能(Molecular function)进行GO富集,结果显示2985个差异表达基因显著富集在1756个GO terms中,包括992个生物学过程,207个细胞组分和557个分子功能.DEHP作用下罗非鱼肝脏差异表达基因主要参与细胞过程(Cellular process)、代谢过程(Metabolic process)和单有机体过程(Single-organism process)等生物学过程.从细胞组成看,差异表达基因主要定位于细胞(Cell)、细胞组分(Cell part)和膜(Membrane)中.从分子功能上分析差异基因主要为结合类(Binding)和催化类(Catalytic)(图2) .差异表达基因KEEG富集分析结果显示2932个差异基因分布在303个通路中.其中富集最显著的前20个KEGG通路如表5所示,大量差异表达基因在免疫疾病相关的通路中被显著富集,包括移植排斥(Allograft rejection)、原发性免疫缺陷(Primary immunodeficiency)、自身免疫性甲状腺病(Autoimmune thyroid disease)、移植物抗宿主疾病(Graft-versus-host disease)、系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus)、哮喘(Asthma)和类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis)等.除与免疫疾病相关的基因表达以外,传染病相关的通路在pathway中也被富集,如金黄色葡萄球菌感染(Staphylococcus aureus infection)和肺结核(Tuberculosis).另外,还有其他免疫相关基因在造血细胞谱系(Hematopoietic cell lineage)和吞噬小体(Phagosome)中被显著富集.其次内分泌系统(PPAR signaling pathway)和脂类代谢(Fatty acid metabolism和Fatty acid degradation)相关的差异表达基因也被显著富集.