《表5 差异表达基因富集最显著的前20个KEGG通路》
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《邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯对罗非鱼肝脏转录组影响研究》
将差异表达基因按照生物过程(Biological proeess)、细胞组分(Cellular component)和分子功能(Molecular function)进行GO富集,结果显示2985个差异表达基因显著富集在1756个GO terms中,包括992个生物学过程,207个细胞组分和557个分子功能.DEHP作用下罗非鱼肝脏差异表达基因主要参与细胞过程(Cellular process)、代谢过程(Metabolic process)和单有机体过程(Single-organism process)等生物学过程.从细胞组成看,差异表达基因主要定位于细胞(Cell)、细胞组分(Cell part)和膜(Membrane)中.从分子功能上分析差异基因主要为结合类(Binding)和催化类(Catalytic)(图2) .差异表达基因KEEG富集分析结果显示2932个差异基因分布在303个通路中.其中富集最显著的前20个KEGG通路如表5所示,大量差异表达基因在免疫疾病相关的通路中被显著富集,包括移植排斥(Allograft rejection)、原发性免疫缺陷(Primary immunodeficiency)、自身免疫性甲状腺病(Autoimmune thyroid disease)、移植物抗宿主疾病(Graft-versus-host disease)、系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus)、哮喘(Asthma)和类风湿性关节炎(Rheumatoid arthritis)等.除与免疫疾病相关的基因表达以外,传染病相关的通路在pathway中也被富集,如金黄色葡萄球菌感染(Staphylococcus aureus infection)和肺结核(Tuberculosis).另外,还有其他免疫相关基因在造血细胞谱系(Hematopoietic cell lineage)和吞噬小体(Phagosome)中被显著富集.其次内分泌系统(PPAR signaling pathway)和脂类代谢(Fatty acid metabolism和Fatty acid degradation)相关的差异表达基因也被显著富集.
图表编号 | XD0047230500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.20 |
作者 | 张林宝、胡莹、陈海刚、贾晓平、蔡文贵 |
绘制单位 | 中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室、中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源环境科学观测实验站广东省渔业生态环境重点实验室 |
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