《表3 差异表达基因显著富集的前6个GO分类》

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《水分胁迫下马铃薯萌芽出苗期根系转录组差异表达分析》

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根据马铃薯‘克新1号’在水分胁迫条件下筛选的不同差异表达基因，研究差异表达基因功能GO注释，发现DLWR（重度水分胁迫）中有3 806个差异表达基因被注释；LWR（中度水分胁迫）中有1 107个差异表达基因被注释．对不同样本差异表达基因进行的GO功能显著性富集分析（见图3）可见，在DLWR（重度水分胁迫）中，主要富集在分子功能、生物过程和细胞组成三个方面：在分子功能方面上调基因在酶调节性（GO:0030234）和结构分子（GO:0003735）上显著富集，下调基因在催化活性（GO:0004645）、氧化还原酶活性（GO:0004601）、离子结合（GO:0005509）和转录因子活性（GO:0001071）上显著富集；在生物过程方面上调基因主要分布在基因表达（GO:0010467）、有机物生物合成（GO:1901576）和跨膜转运（GO:0015238）中，下调基因主要分布在化合物代谢（GO:006796）、蛋白质磷酸化（GO:0006468）、细氧化还原过程（GO:0055114）、大分子修饰（GO:0043412）和繁殖（GO:0009856）中；在细胞组成方面上调基因主要在细胞生物合成（GO:0044249）和核糖体（GO:0005840）富集．从最显著富集的前6个GO分类分析看上调表达基因主要与酶调节性（GO:0030234）、基因表达（GO:0010467）和有机物生物合成（GO:1901576）有关，下调表达基因主要与碳水化合物结合（GO:0008061）、离子结合（GO:0005509）和蛋白修饰（GO:0032446）有关（见表3），与中度水分胁迫相比，出现基因下调表达，也说明马铃薯根系只具有一定的抵御胁迫的能力．在LWR（中度水分胁迫）中被GO注释的主要是上调基因，上调基因主要在酶调节性（GO:0030234）、催化活性（GO:0004645）、抗氧化活性（GO:0016702）、碳水化合物结合（GO:0008061）、跨膜转运（GO:0006855）和转运活性（GO:0015238）上显著富集，且是最显著富集的前6个GO分类，这些基因的上调表达对马铃薯适应水分胁迫环境具有重要作用．