《表3 富集到GO分类中的差异表达基因统计》

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《PEG6000模拟干旱胁迫下银杏幼苗叶片的转录组分析》

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为了破译受干旱胁迫影响后银杏幼苗基因表达的主要生物过程，去除了每个时间点特异表达的DEGs，选取了比较后重叠部分的1 005个DEGs进行GO富集分析，进一步得到了可信的531个DEGs。经功能分类，显著富集到了86个代谢途径中（p<0.05），其中富集到生物学过程（BP）途径中有52个，细胞组分（CC）途径中有9个和分子功能（MF）途径中25个。基于GO分析结果生成了条形图（图6），具体富集到每个通路的差异表达数目不同（表3），其中参与到生物学过程的途径中，富集率最高的为碳水化合物代谢过程（GO:0005975），富集的基因数为56个，其次为细胞壁大分子代谢过程（GO:0044036，12个）、木葡聚糖代谢过程（GO:0010411，9个）、细胞壁组织（GO:0071555，18个）、外部封装结构组织（GO:0045229，18个）、细胞壁组织或生物发生（GO:0071554，18个）、半纤维素代谢过程（GO:0010410，9个）、过氧化氢分解过程（GO:0042744，10个）。参与细胞组分的途径中，富集率最高的为细胞外区域（GO:0005576，24个），其次为膜成分（GO:0044425，199个）、膜的固有成分（GO:0031224，199个）、细胞成分（GO:0005575，333个）、膜的组成部分（GO:0016021，198个）、细胞壁（GO:0005618，16个）、外部封装结构（GO:0030312，16个）。最后，参与到分子功能的途径中，富集率最高发生在水解-O-糖基化合物的水解酶活性（GO:0004553，35个），其次为作用于糖基键的水解酶活性（GO:0016798，35个）、核酸结合转录因子活性（GO:0001071，29个）、序列特异性DNA结合的转录因子活性（GO:0003700，29个）、木葡糖基转移酶活性（GO:0016762，9个）。经GO富集分析筛选出的这些差异基因涉及银杏幼苗的代谢、细胞、生物学过程以及信号传导，可能密切参与了银杏幼苗对干旱胁迫的响应调控（表3）。