《表4 差异表达基因和circRNA最显著富集的GO条目》
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《静原鸡胸肌和腿肌肌苷酸特异性沉积相关circRNA的联合分析》
富集的GO条目结果显示,共有5 496个条目得到富集,有740个条目显著富集(P<0.05),富集到生物过程497个条目、细胞组成82个条目、分子功能161个条目。2种肌肉组织差异表达circRNA显著富集于277个生物过程条目、67个细胞组成条目和81个分子功能条目。DEGs和差异表达circRNA显著富集条目结果显示,DEGs和差异表达circRNA都显著富集到碳水化合物代谢等生物过程,并且差异表达circRNA显著富集到基因的转录后调控等生物过程(表4)。KEGG通路富集结果显示,DEGs共富集到111个通路,有12条通路显著富集(图3(a));差异表达circRNA共富集到87个通路,有6条通路显著富集(图3(b))。DEGs和差异表达circRNA都同时富集到糖酵解/糖异生通路(gga00010)、心肌细胞的肾上腺素信号传导(gga04261),并且DEGs富集通路中氨基酸的生物合成(gga01230)、磷酸戊糖途径(gga00030)、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢(gga00250)等通路都与IMP的合成密切相关;差异表达circRNA富集通路中嘌呤代谢(gga00230)显著富集,此外还有多个信号通路被显著富集,如MAPK信号通路(gga04010)、FoxO信号通路(gga04068)。结合GO和KEGG分析可发现,静原鸡IMP的合成可能受到多种机制的调节,包括多种能量代谢通路、信号转导通路和氨基酸代谢通路。此外,在对差异表达circRNA的筛选中,筛选得到37个具有碳水化合代谢、IMP合成和嘌呤核苷酸合成等功能描述的circRNA,并根据其在胸肌和腿肌中的转录水平绘制了聚类分析热图(图4),可以看出这些circRNA聚类结果良好,并且在样本中显著上调或下调。
图表编号 | XD00206317600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.04.01 |
作者 | 王卫振、邓占钊、辛国省、虎红红、禹宝军、蔡正云、顾亚玲、张娟 |
绘制单位 | 宁夏大学农学院、彭阳县畜牧技术推广服务中心、宁夏大学生命科学学院、宁夏饲料工程技术研究中心、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院 |
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